Muzeum gromadzi zbiory dokumentujące historię miasta od średniowiecza do XX wieku. Główna siedziba muzeum mieści się w Ratuszu Głównego Miasta. Najbardziej reprezentacyjną kondygnacją jest pierwsze piętro, mieszczące Wielką Salę Rady, zwaną również Salą Czerwoną oraz Wielką Salę Wety, określaną Salą Białą. Obecnie w ratuszu prezentowane są wystawy z dziejów Gdańska. Dostojna budowla pełni również funkcje recepcyjne. W okresie sezonu turystycznego, przypadającego na wiosenno-letnie miesiące roku, można wejść na galerię widokową wieży, skąd z wysokości ok. 50 m roztacza się wspaniała panorama Gdańska. Specyficznym klimatem Gdańska są dzwony. Na ratuszowej wieży w 2000 r. zamontowany został nowy, wspaniały 37-dzwonowy carillon, wykonany przez holenderską wytwórnię dzwonów i carillonów Royal Eijsbouts w Asten. Grające dzwony ratusza są tłem do wydarzeń w mieście i ich swoistym komentatorem.
Główne wejście do Ratusza prowadzi od ulicy Długiej. Dwubiegowe schody tworzą artystyczną całość z portalem, będącym wraz z przedprożem dziełem Daniela Eggerta z lat 1766-1768. Szczególną uwagę zwraca herb Gdańska podtrzymywany przez dwa lwy, umieszczony nad wejściem do Ratusza. Jest on jedyny w swoim rodzaju, ze względu na to, iż oba lwy są zwrócone w stronę Złotej Bramy, zamiast patrzeć na siebie. Według tradycji miał nadjechać stamtąd król Polski, na którego pomoc liczyli gdańszczanie w tym trudnym dla miasta okresie.
