Muzeum gromadzi sprzęt ciężki Wojska Polskiego i armii obcych, prowadzi działalność poszukiwawczą i wydobywczą oraz organizuje, nadzoruje i uczestniczy w konserwacji obiektów oraz remoncie pomieszczeń i urządzeń fortecznych. Muzeum zostało usytuowane w części XIX-wiecznego rosyjskiego fortu IX Twierdzy Warszawa, przedzielonego ulicą Powsińską na 2 części - większą, obecnie muzeum, i mniejszą - park. Na początku lat 90. XX w. wraz z pozbywaniem się z jednostek przestarzałego sprzętu wojskowego Muzeum Wojska Polskiego utworzyło tu magazyn, pod koniec lat 90. otwarte jako ekspozycja plenerowa i filia muzeum. W forcie tym mieszczą się wystawy stałe: "Polska broń pancerna 1918-1945", "Polskie lotnictwo wojskowe 1917-2000", "Polskie duszpasterstwo wojskowe", "Historia i tradycje Fortu IX Czerniakowskiego". Zbiory Muzeum to zespół ok. 89 tys. obiektów, m in. militaria: broń zaczepna i ochronna, sprzęt wojskowy, umundurowanie i oporządzenie, weksylia (znaki bojowe - sztandary), falerystyka (ordery, odznaczenia, odznaki, oznaki).
Zbiory główne przechowywane są w 8 magazynach (oprócz zabytków umieszczonych na ekspozycjach), podzielone wg rodzajów: broń palna; broń biała; umundurowanie i oporządzenie; sprzęt i oporządzenie jeździeckie; weksylia; ordery i odznaczenia; odznaki i oznaki; uzbrojenie ochronne oraz broń drzewcowa, obuchowa i miotająca; sprzęt wojskowy (kwatermistrzowski, saperski, łączności, medyczny). Każdym zbiorem magazynowym zajmuje się specjalizujący się w danej dziedzinie kustosz.
