Muzeum mieści się w zabytkowej kamienicy na toruńskiej Starówce, bardzo blisko najznamienitszych toruńskich zabytków. Ulica Rabiańska, na której pod numerem 9 mieści się muzeum, zaczyna się wspaniałą Katedrą Św. Janów, kończy zaś, znaną wszystkim i podziwianą Krzywą Wieżą. Muzeum w magiczny sposób przenosi do XVI-wiecznej piernikarni. Po krótkim terminowaniu u mistrza piernikarskiego można nabyć historyczne umiejętności, zdobyte przy wyrobie pierników według najlepszych receptur sprzed 500 lat. Muzeum jest interaktywną formą poznawania historii Torunia i piernikarstwa - i dla dzieci, i dla dorosłych. Poznawanie historii i tradycji w Muzeum to radość i zabawa dla zwiedzających w każdym wieku, nawet najbardziej dojrzałym. Podczas pobytu w Muzeum zwiedzającym towarzyszy i przekazuje tajniki piernikarskiej wiedzy średniowieczny mistrz piernikarski Bartłomiej oraz jego czeladnicy, a także wiedźma korzenna.
Ale nie wystarczy tylko zobaczyć i posmakować - warto także uczestniczyć w procesie powstawania pachnącego ciasta, samodzielnie dodać miodu, tłuczonego kardamonu, imbiru, kory cynamonowej, goździków, a nawet szczyptę pieprzu... Potem zagnieść ciasto, rozwałkować, zamknąć w ozdobnej formie i słuchając legend o pierniku i Toruniu poczekać,aż własny piernik upiecze się w wiekowym piecu....