Muzeum mieści się w XIX-wieczny budynku drewnianym, pierwotnie modrzewiowym, pokrytym pobielonym tynkiem. Budynek zbudowany jest na planie podkowy z dachem dwuspadowym, gontowym. Od strony frontowej ma ganek oparty na dwóch filarach. Dwór otoczony jest parkiem o powierzchni 1,8 ha, w którym przeważają drzewa liściaste. Za sadem okazały spichlerz przeniesiony w 1982 r. z dawnego folwarku Sanguszków w Chyszowie. Ekspozycja stała to pokój prof. Michała Siedleckiego (ożenionego z córką właściciela dworu Franciszka Wolskiego) wybitnego biologa, podróżnika i badacza mórz. Wnętrza dworu wyposażone jak tradycyjny szlachecki dwór galicyjski z wyraźnymi akcentami niepodległościowymi. Raz na kwartał odbywają się w Dworze "Koncerty w Szlacheckim Dworze" , podczas których wykonawcy prezentują koncerty muzyki klasycznej. Dwór związany jest z działalnością niepodległościową w okresie Powstania Styczniowego. W 1973 roku ostatnia jego właścicielka, Jadwiga Tumidajska przekazała obiekt z przeznaczeniem na muzeum.
Obecny wystrój wnętrz nawiązuje do drugiej połowy dziewiętnastego wieku. Frontowa część dworu pełni funkcje reprezentacyjne: tutaj, podobnie jak obecnie znajdował się salon, w pokoju środkowym jadalnia, a obok gabinet. Skrzydło wschodnie dworu przeznaczone było pierwotnie na sypialnie, natomiast zachodnie mieściło kuchnię oraz spiżarnię. Historycznie dwór związany z takimi wydarzeniami jak rabacja chłopska z 1846 roku, powstanie styczniowe oraz II wojna światowa. Na przełomie XIX i XX wieku w dołęskim dworze gościła często krakowska elita kultury i nauki polskiej: Adam Asnyk, Stanisław Wyspiański, Lucjan Rydel, prof. Michał Siedlecki i inni.
