Muzeum powołano w 2011 r. Znajduje się w gmachu Centrum Biblioteczno-Informacyjnego WUM przy ul. Żwirki i Wigury 63, sąsiadującym z Rektoratem, aulą główną, zespołem klinik przy ul. Banacha. Muzeum gromadzi i opracowuje zbiory pochodzące z darów, zakupów, depozytów oraz przekazywane z innych jednostek WUM. Są to, m. in.: rękopisy, starodruki, narzędzia medyczne, dokumenty archiwalne, ikonografia oraz dokumenty życia społecznego. Na parterze budynku zlokalizowano zasadnicze pomieszczenia ekspozycyjne, w których organizowane będą wystawy z udziałem nowoczesnych prezentacji multimedialnych (w trakcie realizacji), spotkania, odczyty. Na pierwszym piętrze znajduje się Galeria Wystaw Czasowych MHM WUM w której lokalizowane są wystawy czasowe dotyczące nie tylko historii medycyny, ale także zagadnień z innych dziedzin nauki, kultury.
Wystawa czasowa VITA BREVIS ARS LONGA… poświęcona jest medycynie starożytnej Grecji w okresie największego rozkwitu. Głównym jej bohaterem jest Hipokrates i jego dziedzictwo oraz starożytni bogowie medycyny greckiej. Tytuł wystawy jest łacińską wersją maksymy Hipokratesa, która po polsku brzmi: „Życie krótkie, sztuka długa… Oznacza to, że do poznania sztuki medycznej nie wystarczy życie jednego człowieka – potrzebna jest praca wielu pokoleń.
