Muzeum mieści się w budynkach: Zamku Książąt Pomorskich z XV wieku, Dworku, Gotyckiego Młyna Książęcego z XIV wieku, Bramie Młyńskiej z XIV wieku i Spichlerzu Richtera z 1780 roku. Muzeum gromadzi eksponaty z zakresu historii, sztuki i etnografii Pomorza Środkowego. W salach muzealnych odbywają się także koncerty, prelekcje, sesje naukowe i lekcje muzealne. Na wystawach o charakterze stałym są eksponowane; w Zamku m.in. "Skarby książąt pomorskich", "Sztuka dawna Pomorza XIV-XVIII w.", "Stanisław Ignacy Witkiewicz - Witkacy (1885-1939), twórczość plastyczna". W Młynie Zamkowym - wystawa etnograficzna "Rzeczywistość kulturowa Pomorza dawniej i dziś" zaś w Spichlerzu Richtera organizowane są wystawy mające charakter czasowy. W budynku dworku mieści się Dyrekcja Muzeum, księgowość oraz administracja. W sezonie letnim muzeum organizuje na Rynku Rybackim w Słupsku Jarmark Gryfitów, do którego atrakcji należą handel starociami, numizmatami, wyrobami jubilerskimi z bursztynu, oraz wyrobami bartniczymi, pokazy walk średniowiecznych, występy artystyczne.
W młynie znajdują się dwie wystawy stałe pod wspólnym tytułem „Rzeczywistość kulturowa Pomorza dawniej i dziś”, na których prezentowana jest kultura materialna dawnej ludności autochtonicznej, m.in. Kaszubów, Słowińców, Krajniaków Złotowskich, mieszkańców Jamna i Łabusza, jak również pamiątki po osadnikach przybyłych na Pomorze po 1945 roku. Na najwyższej kondygnacji młyna znajduje się sala wystaw czasowych. Z młynem sąsiaduje przybudówka, w której znajduje się mała elektrownia wodna.
