W Akwarium Gdyńskim prezentowane są wystawy muzealne dotyczące oceanografii, hydrobiologii oraz akwaria z florą i fauną zarówno morską, jak i słodkowodną. Skład całego Akwarium Gdyńskiego: 215 gatunków łącznie 142 gatunki ryb 3 gatunki płazów 12 gatunków gadów 58 gatunków bezkręgowców 61 rodzin łącznie(rodzina inaczej podgrupa) 48 ryb 3 gadów 1 płazów 9 bezkręgowców. W części muzealnej eksponowane są zbiory odpowiednio spreparowanych okazów flory i fauny morskiej oraz liczne plansze, modele i płaskorzeźby przedstawiają w sposób poglądowy różnorodne wiadomości związane z życiem morza oraz eksploatacją jego zasobów. Stałe ekspozycje muzealne prezentowane są w trzech głównych salach wystawowych: Sali Bałtyckiej i Sali Dydaktycznej. W części muzealnej obejrzeć można również płaskorzeźby przedstawiające gady, ptaki i ssaki morskie oraz ekspozycje ścienne.
Ekspozycje akwaryjne obejmują 54 zbiorników o pojemności od 270 do 16.000 litrów. Zobaczyć w nich można około 1500 zwierząt pochodzących zarówno z wód morskich, jak i słodkich.
