Muzeum przy Zakładzie Historii Medycyny Pomorskiej Akademii Medycznej zostało powołane do życia w 1960 r. Mieści się na trzecim piętrze budynku Rektoratu Pomorskiej Akademii Medycznej. W Muzeum od 1960 r. zaczęto gromadzić archiwalia, starodruki i przedmioty związane z historią nauk medycznych, głównie z regionu zachodniopomorskiego. Stanowiły one własność Zakładu Historii Medycyny bądź były depozytami od osób prywatnych i instytucji. Obecnie podstawą kolekcji są eksponaty związane z historią medycyny: kolekcja mikroskopów oraz eksponaty paleopatologiczne. Znajdują się tu również meble stanowiące wyposażenie XIX-wiecznej apteki wraz z naczyniami aptecznymi, przybory używane do produkcji leków, wagi wraz z odważnikami, moździerze, jak również materiały reklamowe firm farmaceutycznych oraz leksykon preparatów aptecznych dla lekarzy praktyków z 1929. Muzeum ma charakter zamknięty - związane jest ściśle z programem dydaktycznym obowiązującym w trakcie studiów medycznych.
Gmach Rektoratu PAM wpisany jest do rejestru zabytków. Wybudowany w latach 1901-1904, wg projektu Adolfa Wilhelma Meyer-Schwartau – architekta, który był twórcą m.in. Muzeum Narodowego przy wałach Chrobrego. Obiekt wzniesiony w stylu północno – niemieckiego renesansu, z oszczędnym detalem – rzeźbione opaski okienne zwieńczenia i gzymsy z czerwonego piaskowca wezerskiego. Wszystkie elementy z piaskowca są rzeźbione. Dolna cokołowa część budynku jest zdobiona ciemnoczerwonym szwedzkim granitem.
